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应急状态下新冠流行曲线预测的方法学研究——基于北京市百度搜索和传统流感样病例监测 Article
张婷, 杨柳飏, 韩萱, 范国辉, 钱捷, 胡选成, 赖圣杰, 李中杰, 刘志敏, 冯录召, 杨维中
《工程（英文）》 2023年 第31卷 第12期 页码 112-119 doi: 10.1016/j.eng.2023.08.006
麦康森,孟繁伊,马洪明,张文兵
《中国工程科学》 2009年 第11卷 第10期 页码 108-114
通过研究发现，仿刺参体腔液中存在一种新的调理素样分子。推测这种分子是无脊椎动物调理素样分子中的新成员。同时也发现，虽然调理素样分子能够增强吞噬细胞的吞噬作用，但是,它不是单独起作用的，仍然必须依赖体腔液中其他未知成分，而对未知成分的鉴定需要进一步研究。
徐永江,臧 坤,柳学周,史 宝,陈圣毅
《中国工程科学》 2015年 第17卷 第1期 页码 67-73
为了在蛋白水平认识星突江鲽（Platichthys stellatus）胰岛素样生长因子I（IGF-I）的生长调控作用及机制，采用RT-PCR方法扩增了其成熟肽片段，利用原核表达载体pET-28a
左炔诺孕酮宫内释放系统对胰岛素样生长因子-1的影响与预防盆腔炎的相关性研究
吴晓杰,刘霞,陶跃平,王洁
《中国工程科学》 2015年 第17卷 第6期 页码 4-7
目的：研究左炔诺孕酮宫内释放系统对子宫内膜组织胰岛素样生长因子-1（IGF-1）的影响及预防盆腔炎疗效分析。
林元,陈小玲,林晓文,刘敏,徐两蒲,何德钦,高丽素
《中国工程科学》 2014年 第16卷 第5期 页码 73-78
采用以院为基础的病例对照研究，在福建省妇幼保健院(三级甲等医院)募集新近发生的69 例胎儿先天性心脏病病例，以1∶1 配对的方法设立对照组，采用电感耦合等离子体质谱仪分析方法，测定病例组和对照组孕妇孕期头发中锑、锌、铜、铁、铅等元素的含量，并问卷调查孕早期危险因素的暴露情况，用SPSS19.0 Cox 比例风险模型进行流行病学多因素分析。
申颖,戴姝艳
《中国工程科学》 2015年 第17卷 第6期 页码 61-64
普列克底物蛋白同源物样结构域家族A成员1蛋白——导致代谢疾病的多方面细胞存活因素 Review
Tamana Yousof, Jae Hyun Byun, Jack Chen, Richard C. Austin
《工程（英文）》 2023年 第20卷 第1期 页码 9-18 doi: 10.1016/j.eng.2022.05.014
普列克底物蛋白同源物样结构域家族A成员1（PHLDA1）是多作用的胞内蛋白，属于进化上保守的普列克底物蛋白同源相关结构域家族。
血清淀粉样蛋白各亚型在类风湿性关节炎发病机制中的作用 Article
梁丽娴, 赖焕玲, 李润泽, 潘胡丹, 江泽波, 李莹, 段富刚, 徐家辉, 张懿中, 石阿西, 魏春莉, 张方圆, 姚小军, 刘良
《工程（英文）》 2022年 第10卷 第3期 页码 174-182 doi: 10.1016/j.eng.2020.08.018
继发性淀粉样变性是一种致命的并发症。当急性或慢性感染同时伴有血清淀粉样蛋白A 1（serum amyloid A 1, SAA1）分泌过多并在内脏器官积聚时，可诱发淀粉样变性。
多组学导向的链霉菌1647产生的奥米克欣的发现——一组抗甲型流感病毒和冠状病毒HCoV-229E的活性类四肽化合物 Article
孙红敏, 李星星, 陈明华, 钟鸣, 李怡华, 王琨, 杜郁, 甄心, 高荣梅, 巫晔翔, 侍媛媛, 余利岩, 车永胜, 李玉环, 蒋建东, 洪斌, 司书毅
《工程（英文）》 2022年 第16卷 第9期 页码 176-186 doi: 10.1016/j.eng.2021.05.010
像互联网一样智能的电网 Article
刘艳丽, 余贻鑫, 高宁, 吴复立
《工程（英文）》 2020年 第6卷 第7期 页码 778-788 doi: 10.1016/j.eng.2019.11.015
管睿,刘玉环,徐明娟,张俊洁,惠宁,崔英
《中国工程科学》 2015年 第17卷 第6期 页码 45-49
间充质干细胞治疗人感染H7N9禽流感病毒所致急性呼吸窘迫综合征的临床研究——为新冠病毒肺炎救治提供新策略 Article
陈佳佳, 胡晨霞, 陈利军, 汤灵玲, 朱一新, 徐小微, 陈露, 高海女, 鲁晓庆, 俞亮, 戴霞红, 项春生, 李兰娟
《工程（英文）》 2020年 第6卷 第10期 页码 1153-1161 doi: 10.1016/j.eng.2020.02.006
2013年，H7N9病毒在哺乳动物宿主之间迅速传播，并具有人与人之间传播的风险。患者表现为重症肺炎、急性呼吸窘迫综合征（acute respiratory distress syndrome, ARDS）和呼吸衰竭。间充质干细胞（mesenchymal stem cell, MSC）移植在病毒性肺炎的治疗中有广阔的前景，并于2013年作为应急性治疗方法来治疗H7N9感染的ARDS。该研究在单中心开展，为开放式临床研究。根据自愿和知情同意的原则，17例H7N9感染的ARDS患者移植同种异体经血来源的MSC作为治疗组，44例H7N9感染的ARDS患者作为对照组。与对照组相比，MSC移植显著降低了ARDS病死率（MSC治疗组和对照组死亡率分别为17.6％和54.5％）。此外，在对4名MSC移植患者进行为期5年的随访中，未发现MSC移植产生有害影响。总体而言，该研究结果表明MSC移植显著提高了H7N9感染的ARDS的存活率，并为开展临床前和临床应用MSC治疗H7N9感染的ARDS的研究提供了理论基础。由于H7N9和2019新型冠状病毒性肺炎（coronavirus disease 2019, COVID-19）临床表现相似（如ARDS和呼吸衰竭），并继发多器官功能障碍，因此基于MSC的疗法可能为COVID-19所致的ARDS患者获益。
从H1N1血凝素序列提取的沙门氏菌传递的COBRA-HA1抗原对甲型流感亚型产生广谱保护作用 Article
Ram Prasad Aganja, Amal Senevirathne, Chandran Sivasankar, John Hwa Lee
《工程（英文）》 2024年 第32卷 第1期 页码 42-57 doi: 10.1016/j.eng.2023.08.001
A universal vaccine is in high demand to address the uncertainties of antigenic drift and the reduced effectiveness of current influenza vaccines. In this study, a strategy called computationally optimized broadly reactive antigen (COBRA) was used to generate a consensus sequence of the hemagglutinin globular head portion (HA1) of influenza virus samples collected from 1918 to 2021 to trace evolutionary changes and incorporate them into the designed constructs. Constructs carrying different HA1 regions were delivered into eukaryotic cells by Salmonella-mediated bactofection using a Semliki Forest virus RdRp-dependent eukaryotic expression system, pJHL204. Recombinant protein expression was confirmed by Western blot and immunofluorescence assays. Mice immunized with the designed constructs produced a humoral response, with a significant increase in immunoglobulin G (IgG) levels, and a cell-mediated immune response, including a 1.5-fold increase in CD4+ and CD8+ T cells. Specifically, constructs #1 and #5 increased the production of interferon-γ (IFN-γ) producing CD4+ and CD8+ T cells, skewing the response toward the T helper type 1 cell (Th1) pathway. Additionally, interleukin-4 (IL-4)-producing T cells were upregulated 4-fold. Protective efficacy was demonstrated, with up to 4-fold higher production of neutralizing antibodies and a hemagglutination inhibition titer > 40 against the selected viral strains. The designed constructs conferred a broadly protective immune response, resulting in a notable reduction in viral titer and minimal inflammation in the lungs of mice challenged with the influenza A/PR8/34, A/Brisbane/59/2007, A/California/07/2009, KBPV VR-92, and NCCP 43021 strains. This discovery revolutionizes influenza vaccine design and delivery; Salmonella-mediated COBRA-HA1 is a highly effective in vivo antigen presentation strategy. This approach can effectively combat seasonal H1N1 influenza strains and potential pandemic outbreaks.
关键词： COBRA Influenza A Salmonella Vaccine Broad spectral protection
Xueying Lu, Kirk E. Jordan, Mary F. Wheeler, Edward O. Pyzer-Knapp, Matthew Benatan
《工程（英文）》 2022年 第18卷 第11期 页码 96-104 doi: 10.1016/j.eng.2022.06.011
We present a framework that couples a high-fidelity compositional reservoir simulator with Bayesian optimization (BO) for injection well scheduling optimization in geological carbon sequestration. This work represents one of the first at tempts to apply BO and high-fidelity physics models to geological carbon storage. The implicit parallel accurate reservoir simulator (IPARS) is utilized to accurately capture the underlying physical processes during CO2 sequestration. IPARS provides a framework for several flow and mechanics models and thus supports both stand-alone and coupled simulations. In this work, we use the compositional flow module to simulate the geological carbon storage process. The compositional flow model, which includes a hysteretic three-phase relative permeability model, accounts for three major CO2 trapping mechanisms: structural trapping, residual gas trapping, and solubility trapping. Furthermore, IPARS is coupled to the International Business Machines (IBM) Corporation Bayesian Optimization Accelerator (BOA) for parallel optimizations of CO2 injection strategies during field-scale CO2 sequestration. BO builds a probabilistic surrogate for the objective function using a Bayesian machine learning algorithm—the Gaussian process regression, and then uses an acquisition function that leverages the uncertainty in the surrogate to decide where to sample. The IBM BOA addresses the three weaknesses of standard BO that limits its scalability in that IBM BOA supports parallel (batch) executions, scales better for high-dimensional problems, and is more robust to initializations. We demonstrate these merits by applying the algorithm in the optimization of the CO2 injection schedule in the Cranfield site in Mississippi, USA, using field data. The optimized injection schedule achieves 16% more gas storage volume and 56% less water/surfactant usage compared with the baseline. The performance of BO is compared with that of a genetic algorithm (GA) and a covariance matrix adaptation (CMA)-evolution strategy (ES). The results demonstrate the superior performance of BO, in that it achieves a competitive objective function value with over 60% fewer forward model evaluations.
肠道菌群与冠状动脉疾病的发生风险 Article
胡嘉禄, 姚志峰, 唐敏娜, 唐春, 赵晓璠, 苏曦, 卢淡泊, 李秋荣, 王张生, 颜彦, 王则能
《工程（英文）》 2021年 第7卷 第12期 页码 1715-1724 doi: 10.1016/j.eng.2020.05.025
在过去的几年中，小规模队列研究发现肠道菌群随冠状动脉疾病出现而改变。既往研究中所发现的冠状动脉疾病患者肠道中富集或减少的微生物群，在其他冠状动脉疾病队列中是否具有可重复性，有待进一步研究和验证。本研究共纳入78 名受试者，其中19 例受试者无冠状动脉狭窄（Ctrl 组），14 例受试者冠状动脉狭窄程度小于50%（LT50 组），45 例受试者冠状动脉狭窄程度大于50%（GT50 组）。采集受试者粪便标本，并提取DNA 进行16S 核糖体RNA 基因测序。对可执行的分类操作单位（operational taxonomic units, OTU）进行分析以确定不同类群的分类单元，采用多变量logistic 回归分析检验所定义的分类单元是否能独立预测冠状动脉疾病风险。结果显示，δ-变形杆菌纲、梭杆菌属、嗜胆菌属、放线菌属和梭菌XIX属在Ctrl 组中富集；普雷沃氏菌科、副拟杆菌属和芽孢杆菌属在LT50 组中富集；罗氏菌属和丁酸单胞菌属在GT50 组中富集。δ-变形杆菌纲、梭杆菌属、嗜胆菌属和脱硫弧菌科种群的增加与冠状动脉疾病风险降低相关。在相对丰度高于中位数的个体中，冠状动脉疾病风险分别降低为相对丰度低于中位数的个体的0.26 倍、0.21 倍、0.18 倍和0.26 倍（p < 0.05），而普雷沃氏菌科种群的增加与冠状动脉疾病风险增加相关，冠状动脉疾病风险增加5.63 倍（p < 0.01）。使用20 种微生物群联合诊断LT50组与Ctrl组、GT50组与Ctrl组、LT50组+GT50组与Ctrl组、GT50组与Ctrl组+LT50组，受试者工作特征
（ROC）曲线下的面积均高于0.88。然而，除拟杆菌属外，既往研究所报道的在冠状动脉疾病或健康对照组受试者中富集的肠道菌群在本队列并未观察到。总之，冠状动脉疾病与健康对照组受试者具有不同的菌群特征。不同队列研究所发现的冠状动脉疾病富集的肠道菌群特征不具有重复性，提示肠道菌群较难应用于冠状动脉疾病的早期诊断和预防。综合本研究与既往研究结果，只有拟杆菌属丰度减少是冠状动脉疾病进展的可靠标志物。
标题 作者 时间 类型 操作
普列克底物蛋白同源物样结构域家族A成员1蛋白——导致代谢疾病的多方面细胞存活因素
Tamana Yousof, Jae Hyun Byun, Jack Chen, Richard C. Austin
期刊论文
多组学导向的链霉菌1647产生的奥米克欣的发现——一组抗甲型流感病毒和冠状病毒HCoV-229E的活性类四肽化合物
孙红敏, 李星星, 陈明华, 钟鸣, 李怡华, 王琨, 杜郁, 甄心, 高荣梅, 巫晔翔, 侍媛媛, 余利岩, 车永胜, 李玉环, 蒋建东, 洪斌, 司书毅
期刊论文
间充质干细胞治疗人感染H7N9禽流感病毒所致急性呼吸窘迫综合征的临床研究——为新冠病毒肺炎救治提供新策略
陈佳佳, 胡晨霞, 陈利军, 汤灵玲, 朱一新, 徐小微, 陈露, 高海女, 鲁晓庆, 俞亮, 戴霞红, 项春生, 李兰娟
期刊论文
从H1N1血凝素序列提取的沙门氏菌传递的COBRA-HA1抗原对甲型流感亚型产生广谱保护作用
Ram Prasad Aganja, Amal Senevirathne, Chandran Sivasankar, John Hwa Lee
期刊论文
基于样地调查的地质碳储量的贝叶斯优化
Xueying Lu, Kirk E. Jordan, Mary F. Wheeler, Edward O. Pyzer-Knapp, Matthew Benatan
期刊论文
京公网安备 11010502051620号
